제주동여자중학교는 제주시의 동쪽에 위치해 있고, 동쪽은 해가 뜨는 곳으로 태양을 우러르는 해바라기 모양을 표상하여 교표를 만들었다.가운데 흰색은 우리 학생들의 순수한 마음을, 초록색은 희망과 용기를 바깥의 큰 원은 태양과 지구의 둥근 모습으로 온누리를 안의 작은 원은 핵으로 구심점을 상징한다.즉 순수한 마음으로 희망과 용기를 갖고 현재보다 미래를 소아보다 대아를, 음지보다 양지를 향해 올곧게 나아감으로써 온누리를 환하게 밝히는 구심점 역할을 할 제주동여자중학생의 진취적 기상과 바르고 착한 심성을 의미한다.